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SARS-CoV-2 변이주

SARS-CoV-2 변이주

Novel Coronavirus SARS-CoV-2.jpg

코로나바이러스감염증-19(코로나19)를 일으키는 SARS-CoV-2는 다수의 변이가 있다. 일부는 전염성이 증가하거나, 독성이 늘거나, 백신의 효과가 감소하기 때문에 특히 중요하다. 사상 최초의 코로나19 변이 바이러스는 2020년 1월 1일 발생한 B.1.499 바이러스이며 코로나 바이러스는 이후에도 계속 변이하면서 세계의 여러가지의 다양한 변이 바이러스가 탄생하고 있다.

개괄

상대적 위험도:   매우 높음   높음   보통   낮음   매우 낮음   알 수 없음[1][2][3][4][5][6][7]

식별 출현 우한에서 처음 발견된 바이러스와의 차이
WHO[1] PANGO 계통[8] PHE 변종[A] Nextstrain clade[9][2] 첫 발발 초기 샘플 WHO 등급 지정 주요 돌연변이 감염성 병독성 항원성
알파 B.1.1.7 VOC‑20DEC‑01 20I/501Y.V1[B] 영국 2020/9/20[10][11] 2020/12/18[12] 69–70del, N501Y, P681H[13][14] +87% (43130%)[15] 치사율: +61% (4282%)[16][C] 변화 없음[18]
베타 B.1.351 VOC‑20DEC‑02 20H/501Y.V2 남아프리카 공화국 2020/5[11] 2021/1/14[19] K417N, E484K, N501Y[13] +50% (2080%)[18] +57%[20] 항체에 의한 중화의 현저한 감소[21][22]
감마 P.1 VOC‑21JAN‑02 20J/501Y.V3 브라질 2020/11[11] 2021/1/15[23][24] K417T, E484K, N501Y[13] +161% (145176%) [25][E] 치사율: +50% (50% CrI, 2090%)[26][D][F] 효과적인 중화의 전반적인 감소[18]
엡실론 B.1.429, B.1.427 20C/S:452R 미국 2020/3[11] 2021/3/17[28] L452R[13] +22% (19%–24%)[2][29] 조사 중 중화 항체에 대한 민감도가 약간 감소[30]
델타 B.1.617.2, AY형 VOC‑21APR‑02 21A/S:478K[11][4] 인도 2020/10[11] 2021/5/6[31] L452R, T478K, P681R[32] +198%[G] +85% (39147%) 알파 변이와 관련[I][J] 효과적인 중화의 약간의 감소[36]
카파 B.1.617.1 VUI‑21APR‑01 21A/S:154K[11] 인도 2020/10[11] L452R, E484Q, P681R[37] 조사 중 조사 중 효과적인 중화의 약간의 감소[36]
에타 B.1.525 VUI‑21FEB‑03[K] 20A/S:484K 영국 2020/12/11[38][39][11] E484K, F888L[42] 조사 중 조사 중 중화 가능성 감소 [2]
오미크론 B.1.1.529, BA형 VUI-21NOV-01 21K 보츠와나 2021/11/9 2021/11/26 P681H, N440K, N501Y, S477N, E484A, Q493R, 기타 +792% (3961188%)[43] −65% (−75−54%) 델타 변이와 관련

[43][44]

중화기능 측정불가 수준으로 현저히 감소

대한민국으로의 유입 및 발생 날짜

발생 국가 이름 발생 날짜 보고된 전세계 총 누적 확진환자 대한민국으로의 유입 여부 보고된 대한민국의 총 누적 확진환자 비고 최대 치사율 스파이크 단백질 돌연변이 유입된 국가의 수 판고 혈통
중국 중국 코로나 19 2019년 12월 1일 1억 7천만명 이상 O 15만명 이상 코로나19 바이러스 원형 +0%/2.2% D614G 198 A, B, B.1, B.1.1
영국 영국 알파 2020년 2월 7일 127만명 이상 O 3,262 WHO 지정 우려변이였으나 해제됨 +74%/3.83% Δ69-70, Δ144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H, (L452R), (E484K), (E484Q), (S494P), 182 B.1.1.7
남아프리카 공화국 남아프리카공화국 베타 2020년 2월 15일 36,272 O 150 WHO 지정 우려변이였으나 해제됨 +57%/3.45% L18F, D80A, D215G, Δ242-244, R246I, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V 122 B.1.351
브라질 브라질 감마 2020년 4월 7일 113,454 O 25 WHO 지정 우려변이였으나 해제됨 +90%/4.18% L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y, (K417N) 79 P.1 (B.1.1.28.1)
인도 인도 델타 2020년 3월 27일 1억명 이상 O 50만명 이상 WHO 지정 우려변이 +230%/7.26% Δ157-158, T19R, E156G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N, (N501S), (E484Q), 및 9개 186 B.1.617.2, AY형
미국 미국 엡실론 2020년 1월 26일 75,158 O 666 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? S13I, W152C, L452R, D614G 55 B.1.427, B.1.429
브라질 브라질 제타 2020년 4월 13일 5,546 O 6 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? E484K, D614G, V1176F 45 P.2 (B.1.1.28.2)
영국 영국, 나이지리아 나이지리아 에타 2020년 3월 25일 9,777 O 12 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? Δ69-70, Δ144, Q52R, A67V, E484K, D614G, Q677H, F888L 87 B.1.525
필리핀 필리핀 세타 2021년 1월 8일 654 O 9 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? Δ141-143, E484K, N501Y, D714G, P681H, E1092K, H1101Y, V1176F 20 P.3 (B.1.1.28.3)
미국 미국 요타 2020년 1월 28일 46,600 O 15 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? L5F, T95I, D253G, E484K, D614G, A701V 51 B.1.526
인도 인도 카파 2020년 3월 3일 7,959 O 23 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? T95I, G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, P681R, Q1071H 62 B.1.617.1
페루 페루 람다 2020년 7월 21일 9,768 X 0 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 ? G75V, T76I, Δ246-252, L452Q, F490S, D614G, T859N 40 C.37 (B.1.1.1.37)
콜롬비아 콜롬비아 2020년 12월 15일 17,007 O 3 WHO 지정 관심변이였으나 해제됨 높을것으로 추정 T95I, Y144S, Y145N, R346K, E484K, N501Y, D614G, P681H, D950N 57 B.1.621, B.1.621.1
보츠와나 보츠와나 오미크론 2021년 11월 9일 2억명 이상 O 1500만명 이상 WHO 지정 우려변이 -54%/1.01% Δ25-27, A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, N211I, Δ212, 215EPEins, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F 164 B.1.1.529, BA형
스페인 스페인 20A.EU1 2020년 2월 2일 164,084 O 23 WHO 정식명칭 X ? A222V, D614G 96 B.1.177
덴마크 덴마크 클러스터 5 2020년 6월 8일 1,252 X 0 WHO 정식명칭 X ? Δ69-70, N439K, Y453F, D614G, P681H 27 B.1.1.298
남아프리카 공화국 남아프리카공화국, 영국 영국 스텔스 오미크론 2021년 1월 1일 1000만명 이상 O 100만명 이상 WHO 정식명칭 X ? T19I, LPPA24-27S, G142D, V213G, G339D, S371F, S373P, T376A, D405N, R408S, K417N, N440K, S477N, T478K, E484A, Q493R, Q498R, N501Y, Y505H, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, Q954H, N969K 119 BA.2 (B.1.1.529.2)
유럽 유럽 SARS-CoV-2 델타플러스 변이 2021년 3월 31일 3,282 O 7 WHO 지정 정식명칭 X, 인도 보건당국 지정 우려변이 ? K417N, L452R, T478K, P681R, (T478R) 48 AY.1 (B.1.617.2.1)
카메룬 카메룬 IHU 2021년 10월 15일 69 X 0 WHO 정식명칭 X ?  R346S, E484K, Y449N, F490S, N501Y, P681H 및 40개 14 B.1.640.2
키프로스 키프로스 델타크론 2021년 12월 21일~2022년 1월 7일 245 X 0 실험실 오류인줄 알았으나 실제로 존재, WHO 정식명칭 X ? A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, L452R, T478K, D614G, Q954H, N969K, L981F 10 XD, XF, XS 및 5종

대한민국에서 발생한 변이

발생 국가 이름 발생 날짜 보고된 전세계 총 누적 확진환자 보고된 대한민국의 총 누적 확진자 비고 변이가 유입된 국가의 수
대한민국 대한민국 B.41 2020년 2월 6일 135 131 대한민국에서 발생한 최초의 변이 3
A.24 2020년 3월 22일 14 9 대한민국발 변이중 가장적은 사람이 감염된 변이 4
B.1.497 2020년 5월 5일 3,202 3,153 13
K.1 (B.1.1.277.1) 2020년 5월 7일 39 34 3
B.1.619.1 2020년 9월 14일 1,579 1,541 13
AY.122.5 (델타) 2021년 1월 28일 4,173 4,144 13
AY.69 (델타) 2021년 5월 15일 11,311 11,231 대한민국발 변이중 가장많은 사람이 감염된 변이 18
BA.1.1.5 (오미크론) 2021년 11월 15일 893 634 27
B.1.3.1 ?월 ?일 ? ? ?
B.1.1.183 ?월 ?일 ? ? ?

우세종이 될 가능성이 있는 변이

발생 국가 이름 발생 날짜 보고된 전세계 총 누적 확진환자 보고된 대한민국 총 누적 확진자 비고
미국 미국 BA.2.12.1 변이 (오미크론) 2021년 12월 14일 9,205 6 스텔스 오미크론 보다 전염성이 25% (23~27%) 높은 변이

감염 사례가 10명 미만인 변이

발생 국가 이름 발생 날짜 보고된 전세계 총 누적 확진환자 보고된 대한민국 총 누적 확진자 전세계 최대 점유율
탄자니아 탄자니아 A.30 (A.VOI.V2) 2021년 2월 13일 4 0 0.0008%
스페인 스페인 C.21 (B.1.1.1.21) 2020년 9월 15일 7 0 0.0021%
페루 페루 C.25 (B.1.1.1.25) 2020년 3월 20일 8 0 0.0034%
덴마크 덴마크 AQ.2 (B.1.1.39.2) 2020년 8월 24일 9 0 0.0019%
스웨덴 스웨덴 B.1.1.91 2020년 4월 10일 6 0 0.0011%
포르투갈 포르투갈 AM.1 (B.1.1.216.1) 2020년 11월 9일 9 0 0.0002%
스위스 스위스 AH.1 (B.1.1.241.1) 2021년 1월 5일 7 0 0.0004%
미국 미국 B.1.1.357 2020년 7월 8일 8 0 0.0009%
아일랜드 아일랜드 B.1.1.399 2020년 4월 15일 9 0 0.0020%
인도 인도 B.1.1.414 2020년 7월 14일 7 0 0.0007%
러시아 러시아 B.1.1.427 2020년 7월 25일 8 0 0.0004%
남아프리카 공화국 남아공 B.1.1.444 2020년 7월 27일 7 0 0.0004%
러시아 러시아 B.1.1.452 2020년 9월 10일 9 0 0.0009%
니제르 니제르 B.1.1.484 2020년 5월 31일 6 0 0.0010%
영국 영국 B.1.110.2 2020년 4월 3일 6 0 0.0012%
캐나다 캐나다 B.1.316 2020년 4월 29일 7 0 0.0001%
스웨덴 스웨덴 B.1.342 2020년 5월 23일 9 0 0.0030%
영국 영국 B.1.350.1 2020년 5월 25일 7 0 0.0011%
인도 인도 B.1.458 2020년 5월 25일 9 0 0.0102%
독일 독일 B.1.475 2020년 3월 26일 8 0 0.0016%
스웨덴 스웨덴 B.1.488 2020년 7월 13일 5 0 0.0004%
미국 미국 B.1.496 2020년 3월 15일 9 0 0.0178%
아르헨티나 아르헨티나 B.1.499.1 2020년 7월 3일 9 0 0.0005%
스웨덴 스웨덴 B.1.614 2020년 6월 15일 8 0 0.0048%
캐나다 캐나다 B.1.641 2021년 12월 1일 6 0 0.0008%
총 178명

각주

내용주
  1. The naming format was updated in March 2021, changing the year from 4 to 2 digits and the month from 2 digits to a 3-letter abbreviation. For example, VOC-202101-02 became VOC-21JAN-02.[3]
  2. Formerly 20B/501Y.V1.
  3. Another study[17] has estimated that B.1.1.7 may be ~64% (32–104%) more lethal
  4. The reported confidence or credible interval has a low probability, so the estimated value can only be understood as possible, not certain nor likely.
  5. Another study[26] has estimated that P.1 may be 100% (50% CrI, 70140%) more transmissible.[D]
  6. Preliminary results from a study in the Southern Region of Brazil found P.1 much more lethal for healthy young people. In groups without pre-existing conditions, the variant was found to be 490% (220985%) more lethal for men in the 20-39 age group, 465% (1901003%) more lethal for women in the 20-39 age group and 670% (4011083%) for women in the 40-59 age group.[27]
  7. About 40% more transmissible than the Alpha variant.[33]
  8. 7 February – 22 June 22, 2021, Ontario. CFR 0.04% for <50 age group unvaccinated, 6.5% for >50 age group unvaccinated[35]
  9. 1 April – 6 June 2021, Scotland.[34] Another preliminary study in Ontario found that hospitalization by Delta increased by 120% relative to non-VOC lineages.[H]
  10. Differences may be due to different policies and interventions adopted in each area studied at different times, to the capacity of the local health system, or to different variants circulating at the time and place of the study.
  11. Formerly UK1188.
참조주
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  26. Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, Claro IM, Candido DS, Mishra S, 외. (2021년 5월 21일). “Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil”. 《Science》 372 (6544): 815–821. doi:10.1126/science.abh2644. ISSN 0036-8075. PMC 8139423. PMID 33853970. Within this plausible region of parameter space, P.1 can be between 1.7 and 2.4 times more transmissible (50% BCI, 2.0 median, with a 99% posterior probability of being >1) than local non-P1 lineages and can evade 21 to 46% (50% BCI, 32% median, with a 95% posterior probability of being able to evade at least 10%) of protective immunity elicited by previous infection with non-P.1 lineages, corresponding to 54 to 79% (50% BCI, 68% median) cross-immunity ... We estimate that infections are 1.2 to 1.9 times more likely (50% BCI, median 1.5, 90% posterior probability of being >1) to result in mortality in the period after the emergence of P.1, compared with before, although posterior estimates of this relative risk are also correlated with inferred cross-immunity. More broadly, the recent epidemic in Manaus has strained the city’s health care system, leading to inadequate access to medical care. We therefore cannot determine whether the estimated increase in relative mortality risk is due to P.1 infection, stresses on the Manaus health care system, or both. Detailed clinical investigations of P.1 infections are needed. 
  27. Freitas AR, Lemos DR, Beckedorff OA, Cavalcanti LP, Siqueira AM, Mello RC, 외. (2021년 4월 19일). “The increase in the risk of severity and fatality rate of covid-19 in southern Brazil after the emergence of the Variant of Concern (VOC) SARS-CoV-2 P.1 was greater among young adults without pre-existing risk conditions” (Preprint). doi:10.1101/2021.04.13.21255281 – medRxiv 경유. Female 20 to 39 years old, with no pre-existing risk conditions, were at risk of death 5.65 times higher in February (95% CI, 2.9-11.03; p <0.0001) and in the age group of 40 and 59 years old, this risk was 7.7 times higher (95% CI, 5.01-11.83; p <0.0001) comparing with November–December. ... The heterogeneity observed between the age groups was greater when we analyzed the subgroup of the population without preexisting risk conditions where we found that the CFR in the female sex in the second wave was 1.95 times (95% CI, 1.38-2.76) the CFR of the first wave in the population over 85 years old and was 7.7 times (95% CI, 5.01-11.83; p < 0.0001) in the population between 40 and 59 years old. In the male population without previous diseases, the CFR in the second wave was 2.18 (95% CI, 1.62-2.93) times the CFR of the first wave in the population over 85 years old and 5.9 (95% CI, 3.2-10.85; p < 0, 0001) higher in the range between 20 and 39 years old. 
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